En 2005, la filiale M3 Systems Belgium est créée, elle se spécialise dans le domaine du contrôle du trafic aérien et dans les applications du GNSS. Au fil des ans une forte expertise est développée sur le thème de la gestion des flux aériens ce qui permettra de proposer des innovations qui serviront de base aux nouveaux systèmes européens de gestion du trafic aérien développés dans le cadre du programme SESAR.
Toujours en 2005, M3 Systems se fait remarquer en gagnant deux projets européens : AIRNET (Géolocalisation des véhicules aéroportuaires) et MITRA (Suivi des transports des matières dangereuses). Simultanément, la société est impliquée dans des études de performance des futurs systèmes EGNOS et participe à l’implémentation des algorithmes d’intégrité définis par les standards de l’Aviation Civile. Ces algorithmes seront implémentés dans la solution de géolocalisation des véhicules aéroportuaires qui va donner naissance au produit e-trackair.